Procesy logistyczne w magazynach e-commerce realizowane są w sposób zbliżony do handlu tradycyjnego. Występują jednak istotne różnice, które trzeba brać pod uwagę już na etapie projektowania magazynu.
Kluczowym elementem wpływającym na efektywność pracy magazynu jest czas kompletacji zamówień. Wpływa on zarówno na koszty funkcjonowania magazynu, jak i jakość obsługi klientów.